世界末日1998

2069年，清洁能源革命完成，月球成为解决地球能源危机的理想之地。一艘国际能源集团的月球运输船被偷袭，所运载的新型核能材料He-3被曾经叛逃能源集团的科学狂人KSTAN劫持，KSTAN妄图用He-3配合氢同位素完成他的机甲核心来摧毁能源集团。于是此时已经流入黑市的氢同位素混合器，成为了国际能源集团（科技商业组织）、东亚安全联合部（政府部门）和以KSTAN为首的黑色黎明组织（恐怖组织）三方势力的共同目标，一场围绕氢同位素的混战即将打响······

在近未来的东海市，一种名为“心理病毒”的幽灵在数字世界蔓延。神秘组织利用直播频率、连麦暗示及直播设备后门，精准猎杀患有表演型人格障碍的网红群体，令其在梦境迷宫中精神崩溃，同时对外扩散心理病毒。富二代催眠师林默，表面玩世不恭，实则拥有顶尖的暗示操控能力；心理学家苏暖，擅长微表情读心与侧写，是冷静自立的“好学生”代表。两人搭档AI机器人阿蒙，组成“心理特种部队”，潜入受害者梦境进行极限营救。

圣诞节，米格兰一家发现全家已被神秘的金属物质包围，但究竟是什么，工业事故？恐怖袭击？核战争？在电视机上出现了“进一步的指示”，他们按照电视机的指示，展开了血腥的屠杀…

军方和汽车人的秘密合作计划面临被取消的危险，而重新复活的威震天和红蜘蛛引领霸天虎军队，密谋夺取能量源，企图在地球掀起又一场腥风血雨。　　此时主人公萨姆（希安·拉博夫 Shia LaBeouf 饰）告别相恋的女友米凯拉（梅根·福克斯 Megan Fox 饰），要开始自己梦寐以求的大学生活了，但一切似乎都不那么顺利，一块小小的魔方碎片似乎在给予萨姆某种启示。为了获取魔方里的信息，霸天虎开始了对萨姆的追击，擎天柱为了保护萨姆而牺牲，萨姆受其感召，决定重新担负起自己的使命。　　萨姆在自己室友里奥（雷蒙·罗德里格斯 Ramon Rodriguez 饰）和“机器战士”西蒙斯（约翰·托尔托罗  John Turturro 饰）的帮助下，与女友米凯拉根据魔方碎片给萨姆的提示来到了埃及，他们在金字塔里发现了能量源。而此时，霸天虎的军队也赶到了埃及。军方此时有一小队人马也在西荤斯的要求下带着擎天柱的尸体来到了埃及，善恶双方力量在那片金色的沙漠展开了殊死搏斗。